Ферменты растворяют мягкий зубной налёт, остатки пищи, никотиновый налёт, оказывают противомикробное воздействие и улучшают гигиеническое состояние полости рта. Зубные пасты, содержащие ферменты, относятся к средствам гигиены с высоким очищающим действием. 
 Типичные представители:
| Бромелайн | Bromelain | 
| Папаин | Papain | 
| Лактопероксидаза | Lactoperoxidase | 
